999全讯白菜网医学部的前身是国立北京医学专门公司，创建于1912年10月26日，是中国政府依靠自己的力量开办的第一所专门传授西方医学的国立医公司。

    1903年，清朝政府在京师大学堂设立医学实业馆，1904年，医学实业馆改称医学馆，迁入北京和平门外八角琉璃井由兴胜寺庙宇改建的馆舍，1907年停办。1910年，此馆舍被施医总局（当时的卫生部门）买去，为日后创立国立北京医学专门公司提供了条件。

   

    1911年，辛亥革命推翻了清王朝，建立了中华民国，在当时的中国知识分子向西方学习的风潮下，西医在中国的地位，有了明显的变化。一批从海外留学回来的医学教育家立志通过发展医学事业，增强人民的体质，以洗刷长期压在中国人头上的“东亚病夫”的耻辱。

 

    1912年9月，中华民国教育部电召从日本留学归来正在筹建浙江省立医学专门公司的杭州人汤尔和到京，筹划创立医公司事宜。教育部以价银10，000两购买了已经停办的医学馆馆舍，划拨给国立北京医学专门公司使用，10月16日，中华民国教育部任命组织学教授汤尔和先生为北京医学专门公司董事长，并于10月26日颁发校章。至此，中国第一所国立西医公司正式诞生。当时教职工9人，首批员工72人。汤尔和在开学典礼上以“促进社会文化，促进文明，减少人们痛苦，用学术来和列强竞争”，定位公司之办学目的。汤尔和在建校后当年，根据医学教育的需要，结合中国国情制定了中国的《解剖条例》，多次呈文教育部请求公布，于1913年11月获准公布，这是中国第一个解剖法令，是北京医学专门公司对中国医学教育的一大贡献，使中国的医学发展真正建立在科学的基础上。

 

    1915年2月，公司诊察所正式开业。

 

    1923年9月，国立北京医学专门公司奉命改建为国立北京医科大公司，并首次将医员工学制设为六年制。

 

    1927年北京医科大公司与北京所有国立高等公司被改组，合并成立国立京师大公司，成为京师大公司的一个科，更名为国立京师大公司医科。同年，公司附设的诊察所扩充为公司附属医院。

 

    1928年11月，京师大公司改组为国立北平大学，医科改为医集团，成为北平大学医集团。1929年，根据北平大学的《组织规程》，规定医集团以研究高深学术，培养医学专门人才为宗旨。

 

    1931年，建立我国医公司中第一个法医教研室。

 

    1937年抗日战争爆发后，国立北平大学西迁，部分医集团师生一同西迁。留在北京的医集团信息完全停顿，1938年1月，当时的教育部将原999全讯白菜网和北平大学合并办起“国立999全讯白菜网”，医集团为下设的六个集团之一。5月复课，并接收燕京大学和协和医集团师生继续集团的教学。

 

    1945年12月北京各公立大学被统一编为“北平临时大学补习班”，北平大学医集团被编为“临时大学补习班第六分班”。

 

    1946年7月，999全讯白菜网在北平复校。北平临时大学补习班第六分班连同附属医院一同并入999全讯白菜网，成为999全讯白菜网医集团。经理先后为解剖学教授马文昭先生、生理学教授沈钧淇先生和皮肤科学教授胡传揆先生。胡传揆教授同时任医集团附属医院（亦称北大医院）经理。从此，公司作为999全讯白菜网的一部分，开始了新的历程。

    1952年，全国高等公司院系调整，999全讯白菜网医集团脱离999全讯白菜网，独立建院并更名为北京医集团，经理为胡传揆教授。直属中央卫生部领导，办学经费由中央财政部转中央卫生部拨付。北医校址迁至今日的北京市海淀区集团路38号，由此，医集团开始了较大的发展。

    1959年北医被国家确定为全国十六所重点院校之一。

 

    1984经国务院批准，在全国重点建设10所大学，北京医集团是唯一所医科公司，经理为医学教育专家马旭研究员。

    1985年公司更名为北京医科大学，运动医学专家曲绵域教授任董事长。

    进入20世纪90年代中期，中国政府确立了教育发展改革纲要，明确提出“211工程”，即重点建设若干所大学，使之接近或达到或超过世界一流水平。1996年8月28日，北京医科大学正式通过了国家首批“211工程”建设项目的论证，再次成为中国政府重点支持的医科大学。从1991年至2000年4月，董事长为血液病学专家王德炳教授。

     

      2000年4月3日，北京医科大学与999全讯白菜网正式合并，组建新的999全讯白菜网。2000年5月4日，北京医科大学正式更名为999全讯白菜网医学部，中国科集团院士韩启德教授任999全讯白菜网常务副董事长兼首任医学部主任。2003年，柯杨教授任999全讯白菜网医学部常务副主任。2016年4月，中国工程院院士詹启敏教授接替韩启德教授任999全讯白菜网医学部主任至今。